隨著電子商務的推廣，網站競爭的越來越激烈，對鏈接結構設計的要求已經不僅僅局限于可以方便快速的瀏覽，更加注重個性化和相關性。例如，一個愛嬰主題網站里，在8個月嬰兒的營養問題頁面上，你需要加入8個月嬰兒的健康問題鏈接，智力培養鏈接，或者是有關奶粉宣傳的鏈接，一本圖書，一個玩具的鏈接。因為父母不可能到每個欄目下去尋找關于8個月嬰兒的信息，他們可能在找到需要的問題后就離開網站了。如何盡可能留住訪問者，是網站設計者未來必須考慮的問題。

采用什么樣的鏈接結構直接影響到版面的布局。在連接結構確定后，再開始考慮鏈接的效果和形式，是采用下拉表單，仍是用DHTML動態菜單等等。

假如您的站點內容龐大，分類明細，需要超過三級頁面，那么建議你在頁面里顯示導航條，可以匡助瀏覽者明確自己所處的位置。

留意:以上我們都是用的三級頁面舉例。而財經新聞頁和它的子頁面之間是樹狀連接，瀏覽財經新聞1后，你必需回到財經新聞頁，才能瀏覽IT新聞2。就是您常常看到很多網站頁面頂部的，類似這樣:“您現在的位置是:首頁->財經新聞->股市信息->深圳股->深發展”

其中，首頁，財經新聞頁，娛樂新聞頁，IT新聞頁之間是星狀鏈接，可以互相點擊，直接到達。例如你的主菜單放在什么位置，是否每頁都需要放置，是否需要用分幀框架，是否需要加入返回顧回頭頁的鏈接。

關于鏈接結構的設計，在實際的網頁制作中長短常重要一環。所以,有站點為了免去返回一級頁面的麻煩，將二級頁面直接用新開窗口(POP up windows)打開，瀏覽結束后封閉即可。

網站的目錄是指你建立網站時創建的目錄。例如:在用frontpage98建立網站時都默認建立了根目錄和images子目錄。目錄的結構是一個容易忽略的問題，大多數站長都是未經規劃，隨意創建子目錄。目錄結構的好壞，對瀏覽者來說并沒有什么太大的感覺，但是對于站點本身的上傳維護，內容未來的擴充和移植有著重要的影響。

子目錄的建立，首先按主菜單欄目建立。例如:網頁教程類站點可以根據技術類別分別建立相應的目錄，象Flash,Dhtml,Javascript等;企業站點可以按公司簡介，產品介紹，價格，在線定單，反饋聯系等建立相應目錄。